Jeżeli nie znalazłeś poszukiwanej książki, skontaktuj się z nami wypełniając formularz kontaktowy.

Ta strona używa plików cookies, by ułatwić korzystanie z serwisu. Mogą Państwo określić warunki przechowywania lub dostępu do plików cookies w swojej przeglądarce zgodnie z polityką prywatności.

Wydawcy

Literatura do programów

Informacje szczegółowe o książce

Mathematica for Bioinformatics - ISBN 9783319723761

Mathematica for Bioinformatics

ISBN 9783319723761

Autor: Mias

Wydawca: Springer

Dostępność: Wysyłka w ciągu 2-3 dni

Cena: 885,15 zł


ISBN13:      

9783319723761

Autor:      

Mias

Oprawa:      

Hardback

Rok Wydania:      

2018

Ilość stron:      

384

This book offers a comprehensive introduction to using Mathematica and the Wolfram Language for Bioinformatics. The chapters build gradually from basic concepts and the introduction of the Wolfram Language and coding paradigms in Mathematica, to detailed worked examples derived from typical research applications using Wolfram Language code. The coding examples range from basic sequence analysis, accessing genomic databases, differential gene expression, and machine learning implementations to time series analysis of longitudinal omics experiments, multi-omics integration and building dynamic interactive bioinformatics tools using the Wolfram Language. The topics address the daily bioinformatics needs of a broad audience: experimental users looking to understand and visualize their data, beginner bioinformaticians acquiring coding expertise in providing biological research solutions, and practicing expert bioinformaticians working on omics who wish to expand their toolset to include the Wolfram Language.

1 Introduction to Bioinformatics 1.1 Principles of Genomics 1.2 Beyond the Genomes: Multiple Omics 1.3 Systems and Networks 1.4 Bioinformatics in modern genetics 2. A Mathematica Primer for Bioinformaticians 2.1 Getting Started 2.2 Variables 2.3 Lists 2.4 Functions 2.4 Importing and Exporting Data 2.5 Graphics 2.6 Associations and Query 2.7 Wolfram Alpha 2.8 Wolfram Language Resources 3. Statistics for Genomic Analysis 3.1 Probability 3.2 Distributions 3.3 Hypotheses 3.4 Parametric Testing 3.5 Non-parametric Testing 3.6 Markov Chains 3.7 Exploratory Data Analysis 4. Genomic Sequences 4.1 Sequence Alignments 4.2 Pairwise Alignment 4.3 Dynamic Programming 4.4 Processing Sequencing Files <4.5 Processing BLAST Output 5. Databases 5.1 Connecting to Databases 5.2 UCSC Browser and MySQL 5.3 Gene Ontology Annotations 5.4 Biological Pathways 5.5 Genomic Medicine Data Sources 6. Transcriptomics 6.1 Transcriptomic Data 6.2 Quality Control 6.3 Normalization 6.4 Differential Gene Expression 6.5 Visualization 6.6 Classification and Biological Significance 7. Proteomics 7.1 Proteomics Data 7.2 Spectral Visualization 7.3 Quality Control 7.4 Normalization 7.5 Differential Protein Expression 7.6 Visualization 8. Metabolomics 8.1 Metabolomics Data 8.2 Metabolomics Databases 8.3 Metabolomics Data Analysis 8.4 Putative Identification of Compounds 8.5 Clustering and Principal Co mponents Analysis 9. Systems Biology 9.1 Introduction to Systems Biology 9.2 Basic Models 9.3 Visualization of Data 9.4 Beyond Basic Models 10. Networks 10.1 Introduction to Network Analysis 10.2 Basic Network Construction 10.3 Network Properties 10.4 Network Comparison 10.5 Scale Free Networks 11. Time Series Analysis 11.1 Introduction to Time Series 11.2 Regularly Sampled Time Series 11.3 Frequency Representation of Longitudinal Data 11.4 Uneven Sampling 12. Omics Integration and Systems Medicine 12.1 Introduction to Multiple Omics Integration 12.2 Systems Medicine Approaches 12.3 Example Integration of Omics Datasets 13. Bioinformatics Development with Mathematica 13.1 Introduction to Pa ckages< 13.2 Creating a Simple Bioinformatics Package 13.3 Dynamics, Manipulate and Interactive Interfaces

Koszyk

Książek w koszyku: 0 szt.

Wartość zakupów: 0,00 zł

ebooks
covid

Kontakt

Gambit
Centrum Oprogramowania
i Szkoleń Sp. z o.o.

Al. Pokoju 29b/22-24

31-564 Kraków

+48 12 414 3791

+48 12 414 3387


Siedziba Księgarni

ul. Kordylewskiego 1

31-542 Kraków

+48 12 410 5989

+48 12 414 3767

Zobacz na mapie google

Wyślij e-mail

Subskrypcje

Administratorem danych osobowych jest firma Gambit COiS Sp. z o.o. Na podany adres będzie wysyłany wyłącznie biuletyn informacyjny.

Autoryzacja płatności

PayU

Informacje na temat autoryzacji płatności poprzez PayU.

PayU banki

© Copyright 2012: GAMBIT COiS Sp. z o.o. Wszelkie prawa zastrzeżone.

Projekt i wykonanie: Alchemia Studio Reklamy